Gli organi della Sanità militare collaborano, nell’ambito dell’attività di contrasto delle emergenze di salute pubblica, legate prevalentemente alle malattie infettive e diffusive e al bioterrorismo, e della prevenzione e lotta contro l'influenza aviaria e le malattie degli animali, con: il Centro nazionale per la prevenzione e il controllo delle malattie con analisi e gestione dei rischi, previamente quelli legati alle malattie infettive e diffusive e al bioterrorismo, ai sensi dell’articolo 1, del decretolegge 29 marzo 2004, n. 81, convertito dalla legge 26 maggio 2004, n. 138; il Centro nazionale di lotta ed emergenza contro le malattie animali, ai sensi dell’articolo 1 del decretolegge 1° ottobre 2005, n. 202, convertito, dalla legge 30 novembre 2005, n. 244.